大明朝廷内部党争引发援朝大军调动换帅的同时，朝鲜方面同样没闲着。因为此前一段时间的政治和战争表现，柳成龙因功升为领议政，伊斗寿则被降为中枢府事。
在朝鲜的国家体制中，领议政相当于宰相，从制度的角度而言，其在国内的地位类比大明的首辅而更具权威。
柳成龙担任朝鲜宰相之后，首先着手的便是预防日军再次入侵而开始研究防御方案。柳成龙领新任兵曹判书李德馨、吏曹判书李恒福觐见朝鲜王李昖。此时李昖正与金贵人饮茶，见三人前来，便询问方案准备如何。
李德馨答道：“殿下，我们与领相商议过后，已经定下两种方案。其一是养民即养军，所以当全力恢复生产粮食及食盐。”
朝鲜王也认为应当如此，但朝鲜战乱过后土地荒芜，如何尽快完成所需却令朝鲜王费解，好在粮食问题已经由京华方面出面解决，而食盐问题同样可以依此操办，只不过不需要从南疆运输，京华在辽南就有盐场——还是高务实和皇帝合资的。
李恒福也知道京华现在成了朝鲜各类必需品的主要来源，便表示随后会呈交奏疏，称具体方式尽在其中，请李昖阅览。
随后他便说到第二份方案：“关于补充军士，以往朝廷通过训练都监来培养人才，地方还以服兵役来征集，所以只以贫苦的百姓来形成军队, 但从大明强军多出自家丁来看, 若想强军，则无论两班还是乡民，都不应再有良贱之分。需编成束伍，让所有可杀敌之人尽来参与, 一视同仁。”
这个思路对朝鲜的军制冲击很大, 李昖听后十分吃惊，问柳成龙道：“领相, 非要如此不可？两班之前对免贱法、作米法都是好不容才勉强让步, 若是再照方才所言，那士大夫和乡民还有何不同？寡人觉得此事十分为难。”
柳成龙劝道：“殿下, 自太祖建国之时, 卫国军役便是不分身份，是人人都会感到荣耀的义务。但时日一久，两班利用职权及利诱而令人代服军役却渐成惯例。最终在中宗大王时变为理所应当。
两班只为一己之私，贪图富贵安乐, 不敢为国家牺牲, 却还身处高位肆意妄为, 试问被祸害已久的百姓又怎么为国家卖命？臣以为战乱初期士卒溃散, 这也是原因之一。束伍军并非扰乱两班和乡民的身份秩序, 而是恢复太祖之法, 仅此而已。”
李德馨也劝说道：“自殿下准许施行免贱法和作米法后, 民心大振, 束伍军可整顿国家军纪, 克服国乱，望殿下明察。”
李恒福也道：“殿下, 据臣了解，并非所有两班都反对束伍, 两班中部分有志者对束伍极为赞同，士大夫中也有不少在国难中动员义兵, 故臣以为此事并非绝不能被两班接受。”
话虽如此，但李昖担心战乱结束之后反而会令两班造反, 因此颇为犹豫, 踌躇不决。柳成龙劝李昖现在不必担心两班，而是应该预防日军再次入侵，李昖颇感进退两难。
到了这日晚间，世子光海君请见李昖, 李昖问道：“各地义军首领不断上本支持束伍，可是你在背后指使？寡人猜想, 能如此轻易动员他们的, 除你之外也没有别人了。”
光海君坦言道：“殿下所料不差，正是儿臣告知了各地义军首领束伍的意义。儿臣也担忧两班反抗，但儿臣认为此举是为克服战乱所设，而战乱之后也可调节，甚或废除此法——法令之制定自当因时而变。”
他如此坦白，让李昖颇为意外，似笑非笑地说光海君变了不少。光海君面无表情, 轻声答道：“天下人心每天都在变化, 儿臣自然也不例外。”
李昖略微沉默，表示会考虑光海君的建议, 光海君拜谢告退。
另一边，李德馨也对柳成龙表达了对此事的忧虑：“王上左右为难，两班虎视眈眈, 如此则恐怕冲突一触即发，王上最近接受了这么多的改革奏请已是奇迹，束伍一事是否可以暂缓推行？”
然而柳成龙已经下定决心，坚持将改革进行到底。他正欲再去请旨，李恒福匆匆来报，说束伍法已经获得准许，承政院已经开始向全国颁布。柳成龙细问下才知是世子及义军首领们也对此给予了帮助。
这里需要插叙一句，在之前关于光海君能否得到明朝正式册封为世子一事上，柳成龙因表达了否定的观点而深深触动了光海君日渐敏感的内心，自那以后他对柳成龙也时有误解，渐渐疏远，略加敌视。
也正因此，今日之事才令柳成龙感到诧异，而光海君经过长期的挫折和磨砺, 也潜移默化的从贤明宽厚转向满腹心机，心思、做法渐渐涉入党争。
于是朝鲜方面在免贱法和作米法之后, 不论一切身份, 令所有壮丁服兵役的束伍制度开始全面施行。两班士大夫虽多有怨言，但也无力反抗，柳成龙的改革得以深度推进。但不少地方因战乱造成的伤痕还未平复，部分地方官员的贪酷也令百姓苦不堪言。
不久，官军李梦鹤便因此广发粮食，召集百姓反抗，并假扮义军某队首领，煽动义军于忠清道造反，朝鲜备边司因此召开会议，紧急商讨对策。
备边司会议上，李德馨报称李梦鹤已占领鸿山，经青山、青阳而往洪州移动。洪州有林得义及朴名贤把守。义军首领金德龄则奉都元帅权栗之令驰援洪州，巡边使李镒也请令前往援助。
李镒说道：“李梦鹤所率领的本部和义军都已算是经历战阵磨炼，堪称精锐，最开始不过千人的乱军，现在已经过万，即便金德龄援助，我看也是难以应对的，非我李镒出马不能解决此事，请领相允许我去助一臂之力。”
柳成龙干脆回绝，道：“可以派遣的将领很多，我并非发愁没有将帅可用，而是在发愁民心。如果民心此时散去，即便镇压乱军也毫无用处，乱军中大多是被李梦鹤蛊惑的百姓，直接用武力镇压会令我们的改革努力付之东流，故此事当以招抚为主。”
然而意外的是，此时朝鲜王李昖突然来到备边司，指责柳成龙偏袒乱军，柳成龙很是不解。
李昖面带愠色，道：“他们要杀寡人，他们是要推翻国家的逆贼！巡边使李镒听旨，立刻率军前往洪州，剿灭李梦鹤，凡是跟随李梦鹤叛乱之人，一律斩首！而带回李梦鹤首级之人，寡人会不分身份，赐其官职田地。”
柳成龙大吃一惊，连忙劝道：“请殿下三思，现在改革推行不久，部分地方还未能得到恩惠才会有此意外发生，只要再过些时日，百姓自会知道朝廷对他们的用心，他们也会对殿下感恩戴德而忏悔此次罪孽的。”
李昖极不耐烦，摆手道：“领相所言极是，寡人为了安抚百姓不顾两班士大夫反对，坚决实施改革，结果得到的却是这样的谋反，寡人还真是欣慰无比啊！巡边使，你还站在那里做什么？寡人刚才的命令你没听清么？”
李镒急忙领命出击，而李昖也不等柳成龙继续劝说，愤怒地拂袖而去。
李梦鹤率军抵达洪州城外，向所部喊道：“今夜我等便在城外驻扎，明日定要攻陷洪州，只要攻陷此城，红衣将军郭再佑及忠勇将金德龄便会于我等会合，共建繁荣！”群情因此激昂，但柳成龙早已安插细作混入李梦鹤军中劝导百姓。
细作趁机互相斗殴引得关注，并向百姓说道：“大家快来瞧瞧这个疯子，说什么要来帮助我们的金德龄将军反而要来抓捕我们？真是鬼话，直接说害怕官军不就好了！”
另一细作喊道：“是真的啊大哥，是金德龄将军的手下甲吉告诉我的，他们不是要来帮助我们，而是来镇压叛乱啊！啊呀，大哥，快跟我一起走吧，留在这真的会死的！”
此话一出，立刻引得议论纷纷，有农民再三细问，并称在金德龄手下做过义兵，细作高声喊道：“那实在是太好了，那你快跟我们说说，我们是叛军的话，那位将军是能跟我们出生入死的人吗？”
该农民不敢确信，细作之间于是继续大打出手，引来李梦鹤命人抓捕。细作逃后，乡民之间皆惶恐不安，开始陆续逃窜。其中有部分乡民认为如果直接逃跑，这一生都会被当做逆贼被官府追捕，于是决定奉王令取李梦鹤首级赎罪。逃窜之民也逃入了金德龄所在认罪。
金德龄正欲抓捕，领头叫道：“将军，是我，是曾在你手下当过一年义兵的大成。”金德龄仔细观察后疑惑道：“既然是义兵，为何会参加叛军？”
大成答道：“小人回到家乡后，只见二老及家中妻儿都在疫情中死去了，家乡人也所剩无几，于是就一直处于流浪之中，后来听闻将军要和李梦鹤会合，这才特意加入的，结果都是谎言。其中既有像我这样被骗来的人，也有因为生计艰难才被迫参加的人，我也应该去砍掉李梦鹤人头的。”
金德龄震惊不已，连忙问李梦鹤是否已死，大成答道：“是的，昨夜发生内讧，有人已经杀了李梦鹤，将他的首级拿去献给官府，去换取官职和田地了。”